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Rainer Gottfriedsen ist gebürtiger Stuttgarter. Er studierte zwischen 1978 und 1986 Biologie an den Universitäten Tübingen, Stuttgart-Hohenheim, Helsinki und Oulu (Finnland). Die Studienrichtungen waren zunächst Molekularbiologie und Genetik, dann Ökologie, Zoologie, Botanik, Bodenkunde und Agrar-Entomologie. Die Diplomarbeit mit einem bodenzoologischen Thema erfolgte im Bereich des Integrierten Pflanzenschutzes im Ackerbau.
Nach einer zweijährigen Tätigkeit als wissenschaftlicher Mitarbeiter an der Biologischen Station Minden-Lübbecke (Nordrhein-Westfalen) erfolgt seit 1989 die selbständige, freiberufliche Tätigkeit als Biologe und Landschaftsökologe.
Die Arbeitsbereiche umfassen wissenschaftliche, planerische und konzeptionelle Leistungen für Landesbehörden, regionale Verwaltungen, Kommunen, Industrie, Verbände, Planungs- und Ingenieurbüros.
Rainer Gottfriedsen ist Mitglied der Ingenieurkammer Baden-Württemberg (Fachgruppe Landschaftsökologie).
Er ist zwischen 1989 und 2012 Gründungs- und zeitweise Vorstandsmitglied des Berufsverbandes der Landschaftsökologen Baden-Württembergs (BVDL).
Seit 2012 erfolgt eine aktive Mitarbeit im Bundesvorstand des Bundesverbandes Beruflicher Naturschutz - BBN (Freie Berufe, seit 2020 Schriftführer).